SS的去除主要靠物理沉淀、過(guò)濾作用，BOD的去除主要靠微生物吸附和代謝作用，代謝產(chǎn)物均為無(wú)害的穩定物質(zhì)，因此可以使處理后水中殘余的BOD濃度很低。污水中COD去除的原理與BOD基本相同。
N、P去除人工濕地主要利用生物脫氮及植物吸收方法。
作用機理：對污染物的去除與影響物理沉淀可沉淀固體在濕地中重力沉降去除、過(guò)濾，通過(guò)顆粒間相互引力作用及植物根系的阻截作用使可沉降及可絮凝固體被阻截而去除；化學(xué)微生物代謝：利用懸浮的底泥和寄生于植物上的細菌的代謝作用將
懸浮物、膠體、可溶性固體分解成無(wú)機物；通過(guò)生物硝化-反硝化作用去除氮；部分微量元素被微生物、植物利用氧化并經(jīng)阻截或結合而被去除。自然死亡：細菌和病毒處于不適宜環(huán)境中會(huì )引起自然衰敗及死亡，植物植物代謝利用植物對有機物的吸收而去除，植物根系分泌物對大腸桿菌和病原體有滅活作用植物吸收相當數量的氮和磷能被植物吸收而去除，多年生沼澤生植物，每年收割一次，可將氮、磷吸收、合成后分移出人工濕地系統。
污水進(jìn)入濕地系統，污水中的固體顆粒與基質(zhì)顆粒之間會(huì )發(fā)生作用，水流中的固體顆粒直接碰到基質(zhì)顆粒表面被攔截。水中顆粒遷移到基質(zhì)顆粒表面時(shí)，在范德華力和靜電力作用下以及某些化學(xué)鍵和某些特殊的化學(xué)吸附力作用下，被粘附與基質(zhì)顆粒上，也可能因為存在絮凝顆粒的架橋作用而被吸附。
此外，由于濕地床體長(cháng)時(shí)間處于浸水狀態(tài)，床體很多區域內基質(zhì)形成土壤膠體，土壤膠體本身具有極大的吸附性能，也能夠截留和吸附進(jìn)水中的懸浮顆粒。
物理過(guò)濾和吸附作用是濕地系統對污水中的污染物進(jìn)行攔截從而達到凈化污水的目的的重要途徑之一。
植物是人工濕地的重要組成部分。人工濕地根據主要植物優(yōu)勢種的不同，被分為浮水植物人工濕地，浮葉植物人工濕地，挺水植物人工濕地，沉水植物人工濕地等不同類(lèi)型。濕地中的植物對于濕地凈化污水的作用能起到極重要的影響。
首先，濕地植物和所有進(jìn)行光合自養的有機體一樣，具有分解和轉化有機物和其他物質(zhì)的能力。植物通過(guò)吸收同化作用，能直接從污水中吸收可利用的營(yíng)養物質(zhì)，如水體中的氮和磷等。水中的銨鹽、硝酸鹽以及磷酸鹽都能通過(guò)這種作用被植物體吸收，后通過(guò)被收割而離開(kāi)水體。
其次，植物的根系能吸附和富集重金屬和有毒有害物質(zhì)。植物的根莖葉都有吸收富集重金屬的作用，其中根部的吸收能力強。在不同的植物種類(lèi)中，沉水植物的吸附能力較強。根系密集發(fā)達交織在一起的植物亦能對固體顆粒起到攔截吸附作用。
再次，植物為微生物的吸附生長(cháng)提供了更大的表面積。植物的根系是微生物重要的棲息、附著(zhù)和繁殖的場(chǎng)所。相關(guān)文獻表明，植物根際的微生物數量比非根際微生物數量多得多，而微生物能起到重要的降解水中污染物的作用。
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